Museum Vrolik is het anatomisch museum in het AMC. Het museum beheert een internationaal toonaangevende collectie anatomische preparaten, skeletten, schedels, was- en gipsmodellen in instrumenten.
Het is een historische collectie die begonnen is als een privéverzameling van Gerard en Willem Vrolik. Zij waren vader en zoon en beiden hoogleraar anatomie in de 19de eeuw. Zij gebruikten de preparaten om les te geven aan hun studenten geneeskunde. Dat lesgeven aan geneeskunde studenten gebeurt vandaag de dag nog altijd, maar het museum is ook geopend voor alle bezoekers die willen leren over het menselijk lichaam en de geschiedenis van geneeskunde in Amsterdam.
Het museum heeft een vaste presentatie in het AMC die jaarlijks door ca. 20.000 mensen wordt bezocht. Daarnaast organiseert het museum rondleidingen en activiteiten voor het publiek.